北京大学化学与分子工程学院分析化学研究所刘小云

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刘小云，北京大学研究员，基于质谱的蛋白质组学在过去的十年间得到了飞速发展，成为生命分析化学研究中最令人激动的新的前沿领域之一。尽管蛋白质组技术平台在很多方面（比如高灵敏度，高分辨率的新型质谱仪及后期高通量组学数据处理）都有了长足的发展，但蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究对技术的要求远高于核酸。因而继续大力发展以质谱为基础的新技术仍然是蛋白质组学领域的核心方向之一。与此同时，运用所发展的新方法来解决实际生物学问题也是关键一环。 研究将集中于从整体或系统层次大规模表征感染过程中病原细菌和宿主细胞蛋白质表达水平及翻译后修饰的变化，并以此揭示病原菌致病的分子机理，为设计和研究抗感染新药提供理论基础。

刘小云
特聘研究员，博士生导师
研究方向：生物质谱，蛋白质组学，病原微生物
电话： +86-10-62759813
E-mail: xiaoyun.liu(AT)pku.edu.cn
课题组网站：www.chem.pku.edu.cn/proteomics
学术背景
2012-至今 北京大学化学与分子工程学院，研究员
2009-2012 耶鲁大学医学院，博士后
2003-2008 印第安那大学化学系，博士
2001-2003 密歇根州立大学化学系，硕士
1997-2001 吉林大学化学系，学士

研究领域：
基于质谱的蛋白质组学在过去的二十年间得到了飞速发展，成为生命分析化学研究中最令人激动的前沿领域之一。尽管蛋白质组技术在诸多方面都有了长足的发展，但蛋白质的可变多样性等特殊性质决定了蛋白质研究对技术的要求远高于核酸。课题组致力于发展新型高通量、高灵敏度蛋白质组学方法并从整体层次大规模分析细菌感染中蛋白质表达及翻译后修饰的动态变化，以期揭示细菌致病的分子机理,为设计和发展抗感染新药提供重要的理论基础。

近期代表性论文：
1.        Liu Y, Liu Q, Qi L, Ding T, Wang Z, Fu J, Hu M, Li M, Song J, Liu X. (2017) Temporal regulation of a Salmonella Typhimurium virulence factor by the transcriptional regulator YdcR. Mol. Cell. Proteomics, in press.
2.        Qi L, Hu M, Fu J, Liu Y, Wu M, Yu K, Liu X. (2017) Quantitative proteomic analysis of host epithelial cells infected by Salmonella enterica serovar Typhimurium, Proteomics, in press.
3.        Yu K, Wang Z, Zhou F, Jiang J, Liu Y, Hu M, Liu X (2017) Quantitative analysis of Shigella flexneri protein expression under acid stress. Proteomics, in press.
4.        Fu J, Qi L, Hu M, Liu Y, Yu K, Liu Q, Liu X. (2017) Salmonella proteomics under oxidative stress reveals coordinated regulation of antioxidant defense with iron metabolism and bacterial virulence. J. Proteomics, 157, 52-58.
5.        Liu Y, Yu K, Zhou F, Ding T, Yang Y, Hu M, Liu X. (2017) Quantitative proteomics charts the landscape of Salmonella carbon metabolism within host epithelial cells. J. Proteome Res., 16, 788-797.
6.        Qiu J, Sheedlo MJ, Yu K, Tan Y, Nakayasu ES, Das C, Liu X, Luo ZQ. (2016) Ubiquitination independent of E1 and E2 enzymes by bacterial effectors. Nature, 533, 120-124.
7.        Liu Y, Zhang Q, Hu M, Yu K, Fu J, Zhou F, Liu X. (2015) Proteomic analyses of intracellular Salmonella enterica serovar Typhimurium reveal extensive bacterial adaptations to infected host epithelial cells. Infect. Immun., 83, 2897-2906.
8.        Hu M, Liu Y, Yu K, Liu X. (2014) Decreasing the amount of trypsin in in-gel digestion leads to diminished chemical noise and improved protein identifications. J. Proteomics, 109, 16-25.
9.        Mukherjee S*, Liu X*, Arasaki K, McDonough J, Galán JE, Roy CR. (2011) Modulation of Rab GTPase function by a protein phosphocholine transferase. Nature, 477, 103-106. (*equal contributions)
10.        Lara-Tejero M, Kato J, Wagner S, Liu X, Galán JE. (2011) A sorting platform determines the order of protein secretion in bacterial type III systems. Science, 331, 1188-1191.

奖励
2016 优秀青年科学基金
2013 中组部青年##计划

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2019自然科学基金面上项目-化学蛋白质组学鉴定百里香酚在沙门氏菌内的靶标蛋白及作用机理研究
批准号        21974002       
学科分类        组学分析 ( B040106 )
项目负责人        刘小云       
依托单位        北京大学
资助金额        65.00万元       
项目类别        面上项目       
研究期限        2020 年 01 月 01 日 至2023 年 12 月 31 日